Hjerne- og Nervesygdomme består af to afdelinger. Den ene hører organisatorisk til Rigshospitalet og den anden hører organisatorisk til Amager og Hvidovre Hospital, men ligger midlertidigt på Rigshospitalet i Glostrup.
Afdeling for Hjerne- og Nervesygdomme under Amager og Hvidovre Hospital varetager den akutte behandling indenfor hjerne- og nervesygdomme. Afdeling for Hjerne- og Nervesygdomme under Rigshospitalet har ansvaret for at undersøge og behandle patienter, der har behov for højt specialiseret behandling.