Disputatser og Ph.d.-afhandlinger

Invasive candidiasis: Changing epidemiology and introduction of a new in vivo larvae model to study treatment of Candica infections
Astvad, K. M. T. 2018 Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen.
Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning

Experimental and clinical studies of the interaction between iron supplementation and malaria
Castberg, F. C. 2018 Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen.
Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning

Pseudomonas aeruginosa biofilm interaction in an experimental animal wound model - inplications for intervention
Pedersen, H. T. 2018 Faculty of Health and Medical Sciences, University of Copenhagen.
Publikation: Bog/antologi/afhandling/rapport › Ph.d.-afhandling › Forskning

Videnskabelige artikler

The value of EBV DNA in early detection of post-transplant lymphoproliferative disorders among solid organ and hematopoietic stem cell transplant recipients
MATCH in PERSIMUNE study group, Wareham, N. E., Mocroft, A., Sengeløv, H., Da Cunha-Bang, C., Gustafsson, F., Heilmann, C., Iversen, M., Kirkby, N. S., Rasmussen, A., Sørensen, S. S. & Lundgren, J. D. 2018 I : Journal of Cancer Research and Clinical Oncology. 144, s. 1569-1580
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Aging and the evolution of comorbidities among HIV-positive individuals in a European cohort
EuroSIDA study 21 nov. 2018 I : AIDS (London, England). s. 2405-2416
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Defining antimicrobial resistance in cystic fibrosis
Antimicrobial Resistance in Cystic Fibrosis International Working Group & Johansen, H. K. nov. 2018 I : Journal of cystic fibrosis : official journal of the European Cystic Fibrosis Society. 17, 6, s. 696-704 9 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review

Population Pharmacokinetics of the Antimalarial Amodiaquine: a Pooled Analysis To Optimize Dosing
WWARN Amodiaquine PK Study Group & Kurtzhals, J. A. L. okt. 2018 I : Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 62, 10, s. e02193-17
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Evolution of Antibiotic Resistance in Biofilm and Planktonic Pseudomonas aeruginosa Populations Exposed to Subinhibitory Levels of Ciprofloxacin
Ahmed, M. N., Porse, A., Sommer, M. O. A., Høiby, N. & Ciofu, O. aug. 2018 I : Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 62, 8, s. e00320-18
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Can secretory immunoglobulin A in saliva predict a change in lung infection status in patients with cystic fibrosis? A prospective pilot study
Alanin, M. C., Pressler, T., Aanaes, K., Ekstrøm, C. T., Skov, M., Johansen, H. K., Nielsen, K. G., von Buchwald, C. & Høiby, N. aug. 2018 I : Health Science Reports. 1, 8, s. e52-e56 5 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Paper-based sensors for rapid detection of virulence factor produced by Pseudomonas aeruginosa
Alatraktchi, F. A., Noori, J. S., Tanev, G. P., Mortensen, J., Dimaki, M., Johansen, H. K., Madsen, J., Molin, S. & Svendsen, W. E. 2018 I : PLoS One. 13, 3, s. e0194157
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

The use of fluorescent staining techniques for microscopic investigation of polymorphonuclear leukocytes and bacteria
Alhede, M., Stavnsbjerg, C. & Bjarnsholt, T. okt. 2018 I : APMIS - Journal of Pathology, Microbiology and Immunology. 126, 10, s. 779-794 16 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review

Privatisation rescues function following loss of cooperation
Andersen, S. B., Ghoul, M., Marvig, R. L., Lee, Z-B., Molin, S., Johansen, H. K. & Griffin, A. S. 18 dec. 2018 I : eLife. 7, s. pii: e38594
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Postoperative nosocomial infections in patients undergoing major heart surgery
Andersen, L. P. & Harboe, Z. 2018 I : EC Microbiology. s. 424-28
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Urinary tract infections in neurology and neurosurgery indoor patients can be reduced by simple infection control precautions
Andersen, L. P., Aldershvile, D., Hellesøe, A-M. B., Jørgensen, C., Juul, S., Egelund, M., Rønde, D., Neustrup, H. & Brennum, J. 2018 I : EC Microbiology. 14, 11, s. 747-51
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

APX001A In Vitro Activity against Contemporary Blood Isolates and Candida auris Determined by the EUCAST Reference Method
Arendrup, M. C., Chowdhary, A., Astvad, K. M. T. & Jørgensen, K. M. okt. 2018 I : Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 62, 10, s. e01225-18
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Multicentre determination of rezafungin (CD101) susceptibility of Candida species by the EUCAST method
Arendrup, M. C., Meletiadis, J., Zaragoza, O., Jørgensen, K. M., Marcos-Zambrano, L. J., Kanioura, L., Cuenca-Estrella, M., Mouton, J. W. & Guinea, J. nov. 2018 I : Clinical microbiology and infection : the official publication of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. 24, 11, s. 1200-1204 5 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

UV light assisted antibiotics for eradication of in vitro biofilms
Argyraki, A., Markvart, M., Stavnsbjerg, C., Kragh, K. N., Ou, Y., Bjørndal, L., Bjarnsholt, T. & Petersen, P. M. 5 nov. 2018 I : Scientific Reports. 8, 1, s. 16360
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Update from a twelve-year nationwide fungaemia surveillance: increasing intrinsic and acquired resistance causes concern
Astvad, K. M. T., Johansen, H. K., Røder, B. L., Rosenvinge, F. S., Knudsen, J. D., Lemming, L., Schønheyder, H. C., Hare, R. K., Kristensen, L., Nielsen, L., Gertsen, J. B., Dzajic, E., Pedersen, M., Østergård, C., Olesen, B., Søndergaard, T. S. & Arendrup, M. C. apr. 2018 I : Journal of clinical microbiology. 56, 4, s. pii: e01564-17
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Implications of the EUCAST Trailing Phenomenon in Candida tropicalis for the In Vivo Susceptibility in Invertebrate and Murine Models
Astvad, K. M. T., Sanglard, D., Delarze, E., Hare, R. K. & Arendrup, M. C. dec. 2018 I : Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 62, 12, s. e01624-18
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Cytomegalovirus-Specific CD4+ T-cell Responses and CMV-IgG Levels Are Associated With Neurocognitive Impairment in People Living With HIV
Ballegaard, V., Pedersen, K. K., Pedersen, M., Brændstrup, P., Kirkby, N., Buus, A. S., Ryder, L. P., Gerstoft, J. & Nielsen, S. D. 1 sep. 2018 I : Journal of acquired immune deficiency syndromes (1999). 79, 1, s. 117-125 9 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Cytomegalovirus-specific T-cells are associated with immune senescence, but not with systemic inflammation, in people living with HIV
Ballegaard, V., Brændstrup, P., Pedersen, K. K., Kirkby, N., Stryhn, A., Ryder, L. P., Gerstoft, J. & Nielsen, S. D. 28 feb. 2018 I : Scientific Reports. 8, 1, s. 3778
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Bacterial Aggregates Establish at the Edges of Acute Epidermal Wounds
Bay, L., Kragh, K. N., Eickhardt, S. R., Poulsen, S. S., Gjerdrum, L. M. R., Ghathian, K., Calum, H., Ågren, M. S. & Bjarnsholt, T. 1 maj 2018 I : Advances in Wound Care. 7, 4, s. 105-113
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Influence of periodontal treatment on subgingival and salivary microbiotas
Belstrøm, D., Grande, M. A., Sembler-Møller, M. L., Kirkby, N., Cotton, S. L., Paster, B. J. & Holmstrup, P. maj 2018 I : Journal of Periodontology. 89, 5, s. 531-539 9 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Impact of Oral Hygiene Discontinuation on Supragingival and Salivary Microbiomes
Belstrøm, D., Sembler-Møller, M. L., Grande, M. A., Kirkby, N., Cotton, S. L., Paster, B. J., Twetman, S. & Holmstrup, P. jan. 2018 I : JDR clinical and translational research. 3, 1, s. 57-64 8 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Matrix Metalloproteinase Mediated Type I Collagen Degradation is an Independent Predictor of Increased Risk of Acute Myocardial Infarction in Postmenopausal Women
Bertelsen, D. M., Neergaard, J. S., Bager, C. L., Nielsen, S. H., Secher, N. H., Svendsen, J. H., Bihlet, A. R., Andersen, J. R., Karsdal, M. A., Christiansen, C. & Nielsen, H. B. 29 mar. 2018 I : Scientific Reports. 8, 1, s. 5371
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Biofilm formation - what we can learn from recent developments
Bjarnsholt, T., Buhlin, K., Dufrêne, Y. F., Gomelsky, M., Moroni, A., Ramstedt, M., Rumbaugh, K. P., Schulte, T., Sun, L., Åkerlund, B. & Römling, U. okt. 2018 I : Journal of internal medicine. 284, 4, s. 332-345 14 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Adaptation of Pseudomonas aeruginosa to the chronic phenotype by mutations in the algTmucABD operon in isolates from Brazilian cystic fibrosis patients
Candido Caçador, N., Paulino da Costa Capizzani, C., Gomes Monteiro Marin Torres, L. A., Galetti, R., Ciofu, O., da Costa Darini, A. L. & Høiby, N. 2018 I : PLoS One. 13, 11, s. e0208013
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Increased Plasmodium chabaudi malaria mortality in mice with nutritional iron deficiency can be reduced by short-term adjunctive iron supplementation
Castberg, F. C., Maretty, L., Staalsoe, T., Hempel, C., Clasen-Linde, E., Hviid, L. & Kurtzhals, J. A. L. 16 jan. 2018 I : Malaria Journal. 17, 1, s. 34-45 12 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Malaria causes long-term effects on markers of iron status in children: a critical assessment of existing clinical and epidemiological tools
Castberg, F. C., Sarbah, E. W., Koram, K. A., Opoku, N., Ofori, M. F., Styrishave, B., Hviid, L. & Kurtzhals, J. A. L. 11 dec. 2018 I : Malaria Journal. 17, 1, s. 464-475 12 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Should standardized susceptibility testing for microbial biofilms be introduced in clinical practice?
Coenye, T., Goeres, D., Van Bambeke, F. & Bjarnsholt, T. jun. 2018 I : Clinical microbiology and infection : the official publication of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. 24, 6, s. 570-572 3 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Use of diagnostic tests and the appropriateness of the treatment decision in patients with suspected urinary tract infection in primary care in Denmark - Observational study
Córdoba, G., Holm, A., Sørensen, T. M., Siersma, V., Sandholdt, H., Makela, M., Frimodt-Møller, N. & Bjerrum, L. 16 maj 2018 I : BMC Family Practice. 19, 1, s. 65
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Pseudomonas aeruginosa transcriptome during human infection
Cornforth, D. M., Dees, J. L., Ibberson, C. B., Huse, H. K., Mathiesen, I. H., Kirketerp-Møller, K., Wolcott, R. D., Rumbaugh, K. P., Bjarnsholt, T. & Whiteley, M. 29 maj 2018 I : Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 115, 22, s. E5125-E5134
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Lipocalin-2 Functions as Inhibitor of Innate Resistance to Mycobacterium tuberculosis
Dahl, S. L., Woodworth, J. S., Lerche, C. J., Cramer, E. P., Nielsen, P. R., Moser, C., Thomsen, A. R., Borregaard, N. & Cowland, J. B. 2018 I : Frontiers in Immunology. 9, s. 2717
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Primary antibiotic resistance of Helicobacter pylori strains among adults and children in a tertiary referral centre in Lithuania
Dargiene, G., Kupcinskas, J., Jonaitis, L., Vezbavicius, M., Kadusevicius, E., Kupcinskiene, E., Frandsen, T. H., Kucinskiene, R., Kupcinskas, L. & Andersen, L. P. jan. 2018 I : APMIS : acta pathologica, microbiologica, et immunologica Scandinavica. s. 21-28 8 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Detection of Glycan Shedding in the Blood: New Class of Multiple Sclerosis Biomarkers?
DellaValle, B., Manresa-Arraut, A., Hasseldam, H., Stensballe, A., Rungby, J., Larsen, A. & Hempel, C. 4 jun. 2018 I : Frontiers in Immunology. 9, s. 1254
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Laribacter hongkongensis: clinical presentation, epidemiology and treatment. A review of the literature and report of the first case in Denmark
Engsbro, A. L., Nielsen, K. L., Hornum, M. & Andersen, L. P. 1 jun. 2018 I : Infectious diseases (London, England). 50, 6, s. 417-422
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review

The Small RNA ErsA of Pseudomonas aeruginosa Contributes to Biofilm Development and Motility through Post-transcriptional Modulation of AmrZ
Falcone, M., Ferrara, S., Rossi, E., Johansen, H. K., Molin, S. & Bertoni, G. 2018 I : Frontiers in Microbiology. 9, s. 238
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

The Combination of Fosfomycin, Metronidazole, and Recombinant Human Granulocyte-Macrophage Colony-Stimulating Factor is Stable in vitro and Has Maintained Antibacterial Activity
Fonnes, S., Holzknecht, B. J., Gasbjerg, L. S., Weisser, J. J., Hallberg, H. W., Arpi, M. & Rosenberg, J. jun. 2018 I : Arzneimittel-Forschung/Drug Research. 68, 6, s. 349-354 6 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Systematic patient involvement for homebased outpatient administration of complex chemotherapy in acute leukemia and lymphoma
Fridthjof, K. S., Kampmann, P., Dünweber, A., Gørløv, J. S., Nexø, C., Friis, L. S., Nørskov, K. H., Welinder, P. C., Moser, C., Kjeldsen, L. & Møller, T. 2018 I : British Journal of Haematology. 181, 5, s. 637-641
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Mutations causing low level antibiotic resistance ensure bacterial survival in antibiotic-treated hosts
Frimodt-Møller, J., Rossi, E., Haagensen, J. A. J., Falcone, M., Molin, S. & Johansen, H. K. 21 aug. 2018 I : Scientific Reports. 8, 1, s. 12512
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Modelling of ciprofloxacin killing enhanced by hyperbaric oxygen treatment in Pseudomonas aeruginosa PAO1 biofilms
Gade, P. A. V., Olsen, T. B., Jensen, P. Ø., Kolpen, M., Høiby, N., Henneberg, K-Å. & Sams, T. 2018 I : PLoS One. 13, 6, s. e0198909
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Recommendations for enterovirus diagnostics and characterisation within and beyond Europe
Harvala, H. , Broberg, E. , Benschop, K. , Berginc, N. , Ladhani, S. , Susi, P. , Christiansen, C. , McKenna, J. , Allen, D. , Makiello, P. , McAllister, G. , Carmen, M. , Zakikhany, K. , Dyrdak, R. , Nielsen, X. , Madsen, T. , Paul, J. , Moore, C. , von Eije, K. , Piralla, A. & 46 flere Carlier, M., Vanoverschelde, L., Poelman, R., Anton, A., López-Labrador, F. X., Pellegrinelli, L., Keeren, K., Maier, M., Cassidy, H., Derdas, S., Savolainen-Kopra, C., Diedrich, S., Nordbø, S., Buesa, J., Bailly, J-L., Baldanti, F., MacAdam, A., Mirand, A., Dudman, S., Schuffenecker, I., Kadambari, S., Neyts, J., Griffiths, M. J., Richter, J., Margaretto, C., Govind, S., Morley, U., Adams, O., Krokstad, S., Dean, J., Pons-Salort, M., Prochazka, B., Cabrerizo, M., Majumdar, M., Nebbia, G., Wiewel, M., Cottrell, S., Coyle, P., Martin, J., Moore, C., Midgley, S., Horby, P., Wolthers, K., Simmonds, P., Niesters, H. & Fischer, T. K. apr. 2018 I : Journal of clinical virology : the official publication of the Pan American Society for Clinical Virology. 101, s. 11-17 7 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review

Chromosome replication as a measure of bacterial growth rate during Escherichia coli infection in the mouse peritonitis model
Haugan, M. S., Charbon, G., Frimodt-Møller, N. & Løbner-Olesen, A. 8 okt. 2018 I : Scientific Reports. 8, 1, s. 14961
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Selection of ESBL-Producing E. coli in a Mouse Intestinal Colonization Model
Hertz, F. B., Nielsen, K. L. & Frimodt-Møller, N. 2018 I : Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 1736, s. 105-115 11 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Complete Genome Sequence of a Vancomycin-Resistant Sequence Type 203 Enterococcus faecium Strain with vanA Belonging to Complex Type 859
Hoffmann, M., Yao, K., Allard, M., Sanchez, M., Andersen, L. P., Hasman, H. & Hammerum, A. M. jul. 2018 I : Microbiology resource announcements. 7, 2, s. e00815-18
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Polyphasic data support the splitting of Aspergillus candidus into two species; proposal of Aspergillus dobrogensis sp. nov
Hubka, V., Nováková, A., Jurjević, Ž., Sklenář, F., Frisvad, J. C., Houbraken, J., Arendrup, M. C., Jørgensen, K. M., Siqueira, J. P. Z., Gené, J. & Kolařík, M. apr. 2018 I : International journal of systematic and evolutionary microbiology. 68, 4, s. 995-1011 17 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Imaging N-Acyl Homoserine Lactone Quorum Sensing In Vivo
Hultqvist, L. D., Alhede, M., Jakobsen, T. H., Givskov, M. & Bjarnsholt, T. 2018 I : Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 1673, s. 203-212 10 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Biofilm infections: A historical perspective
Høiby, N. & Ciofu, O. 2018 I : Romanian Archives of microbiology and immunology. 77, 3, s. 229-35
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Drug-Driven Phenotypic Convergence Supports Rational Treatment Strategies of Chronic Infections
Imamovic, L., Ellabaan, M. M. H., Dantas Machado, A. M., Citterio, L., Wulff, T., Molin, S., Krogh Johansen, H. & Sommer, M. O. A. 11 jan. 2018 I : Cell. 172, 1-2, s. 121-134.e14
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Implants induce a new niche for microbiomes
Jakobsen, T. H., Eickhardt, S. R., Gheorghe, A. G., Stenqvist, C., Sønderholm, M., Stavnsberg, C., Jensen, P. Ø., Odgaard, A., Whiteley, M., Moser, C., Hvolris, J., Hougen, H. P. & Bjarnsholt, T. aug. 2018 I : APMIS - Journal of Pathology, Microbiology and Immunology. 126, 8, s. 685-692 8 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Qualitative and quantitative determination of quroum sensing inhibition in vitro
Jakobsen, T. H., Alhede, M., Hultqvist, L. D., Bjarnsholt, T. & Givskov, M. 2018 Quorum Sensing: Methods and Protocols, Methods in Molecular Biology. Springer Science + Business Media, Bind 1673
Publikation: Bidrag til bog/antologi/rapport › Bidrag til bog/antologi › Formidling

Mecillinam for the treatment of acute pyelonephritis and bacteremia caused by Enterobacteriaceae: a literature review
Jansåker, F., Frimodt-Møller, N., Benfield, T. L. & Knudsen, J. D. 24 maj 2018 I : Infection and drug resistance. 11, s. 761-771
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review

Combined Staining Techniques for Demonstration of Staphylococcus aureus Biofilm in Routine Histopathology
Jensen, L. K., Henriksen, N. L., Bjarnsholt, T., Kragh, K. N. & Jensen, H. E. 2018 I : Journal of bone and joint infection. 3, 1, s. 27-36 10 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

EUCAST Determination of Olorofim (F901318) Susceptibility of Mold Species, Method Validation, and MICs
Jørgensen, K. M., Astvad, K. M. T., Hare, R. K. & Arendrup, M. C. aug. 2018 I : Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 62, 8, s. e00487-18
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

DNA Damage Repair and Drug Efflux as Potential Targets for Reversing Low or Intermediate Ciprofloxacin Resistance in E. coli K-12
Klitgaard, R. N., Jana, B., Guardabassi, L., Nielsen, K. L. & Løbner-Olesen, A. 2018 I : Frontiers in Microbiology. 9, s. 1438-1443 6 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Schistosomiasis Presenting as Recurring Sigmoid Volvulus in a Danish Man With an Inconspicuous Travel History-A Case Report
Krog, A. D., Axelsson, J. M., Bondgaard, A-L. R. & Kurtzhals, J. A. apr. 2018 I : Open Forum Infectious Diseases. 5, 4, s. ofy057
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Convergent Metabolic Specialization through Distinct Evolutionary Paths in Pseudomonas aeruginosa
La Rosa, R., Johansen, H. K. & Molin, S. 10 apr. 2018 I : mBio. 9, 2, s. e00269-18
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Antibiotic prescribing in paediatric inpatients in Ghana: a multi-centre point prevalence survey
Labi, A-K., Obeng-Nkrumah, N., Sunkwa-Mills, G., Bediako-Bowan, A., Akufo, C., Bjerrum, S., Owusu, E., Enweronu-Laryea, C., Opintan, J. A., Kurtzhals, J. A. L. & Newman, M. J. 20 dec. 2018 I : BMC Pediatrics. 18, 1, s. 391-399 9 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Treatment of candidemia in a nationwide setting: increased survival with primary echinocandin treatment
Lausch, K. R., Søgaard, M., Rosenvinge, F. S., Johansen, H. K., Boysen, T., Røder, B. L., Mortensen, K. L., Nielsen, L., Lemming, L., Olesen, B., Leitz, C., Kristensen, L., Dzajic, E., Østergaard, L. J., Schønheyder, H. C. & Arendrup, M. C. 23 nov. 2018 I : Infection and drug resistance. 11, s. 2449-2459 11 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

High incidence of candidaemia in a nationwide cohort: underlying diseases, risk factors and mortality
Lausch, K. R., Søgaard, M., Rosenvinge, F. S., Johansen, H. K., Boysen, T., Røder, B., Mortensen, K. L., Nielsen, L., Lemming, L., Olesen, B., Leitz, C., Kristensen, L., Dzajic, E., Østergaard, L., Schønheyder, H. C. & Arendrup, M. C. 2018 I : International journal of infectious diseases : IJID : official publication of the International Society for Infectious Diseases. 76, s. 58-63 6 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Cytomegalovirus Viral Load in Bronchoalveolar Lavage to Diagnose Lung Transplant Associated CMV Pneumonia
Lodding, I. P., Schultz, H. H., Jensen, J-U., Kirkby, N., Perch, M., Andersen, C., Lundgren, J. D. & Iversen, M. feb. 2018 I : Transplantation. s. 326-332
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Impact of CMV PCR Blips in Recipients of Solid Organ and Hematopoietic Stem Cell Transplantation
Lodding, I. P., Mocroft, A., da Cunha Bang, C., Gustafsson, F., Iversen, M., Kirkby, N., Perch, M., Rasmussen, A., Sengeløv, H., Sørensen, S. S. & Lundgren, J. D. jun. 2018 I : Transplantation Direct. 4, 6, s. e355
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Cytomegalovirus (CMV) Disease Despite Weekly Preemptive CMV Strategy for Recipients of Solid Organ and Hematopoietic Stem Cell Transplantation
Lodding, I. P., da Cunha Bang, C., Sørensen, S. S., Gustafsson, F., Iversen, M., Kirkby, N., Perch, M., Rasmussen, A., Sengeløv, H., Mocroft, A. & Lundgren, J. D. maj 2018 I : Open Forum Infectious Diseases. 5, 5, s. ofy080
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Incidence of HACEK bacteraemia in Denmark: A 6-year population-based study
Lützen, L., Olesen, B., Voldstedlund, M., Christensen, J. J., Moser, C., Knudsen, J. D., Fuursted, K., Hartmeyer, G. N., Chen, M., Søndergaard, T. S., Rosenvinge, F. S., Dzajic, E., Schønheyder, H. C. & Nørskov-Lauritsen, N. feb. 2018 I : International journal of infectious diseases : IJID : official publication of the International Society for Infectious Diseases. 1, 68, s. 83-87
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Mechanisms of humoral immune response against Pseudomonas aeruginosa biofilm infection in cystic fibrosis
Mauch, R. M., Jensen, P. Ø., Moser, C., Levy, C. E. & Høiby, N. mar. 2018 I : Journal of cystic fibrosis : official journal of the European Cystic Fibrosis Society. 17, 2, s. 143-152 10 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review

IgG avidity to Pseudomonas aeruginosa over the course of chronic lung biofilm infection in cystic fibrosis
Mauch, R. M., Nørregaard, L. L., Ciofu, O., Levy, C. E. & Høiby, N. maj 2018 I : Journal of cystic fibrosis : official journal of the European Cystic Fibrosis Society. 17, 3, s. 356-359 4 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Next generation microbiology and cystic fibrosis diagnostics: are we there yet?
Moser, C., Thomsen, T. R. & Høiby, N. nov. 2018 I : Current Opinion in Pulmonary Medicine. 24, 6, s. 599-605 7 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Detection of Polish clinical Aspergillus fumigatus isolates resistant to triazoles
Nawrot, U., Kurzyk, E., Arendrup, M. C., Mroczynska, M., Wlodarczyk, K., Sulik-Tyszka, B., Wróblewska, M., Ussowicz, M., Zdziarski, P., Niewinska, K. & Brillowska-Dabrowska, A. 2018 I : Medical Mycology. 56, 1, s. 121-124 4 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Evaluation of infliximab as second-line treatment of acute graft versus host disease -validating response on day 7 and 28 as predictors of survival
Nygaard, M., Andersen, N. S., Moser, C. E., Olesen, G., Schjødt, I. M., Heilmann, C. & Sengeløv, H. 1 feb. 2018 I : Bone Marrow Transplantation. 53, 7, s. 844-851 8 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Long term survival, health, social functioning, and education in patients with European Lyme neuroborreliosis: nationwide population based cohort study
Obel, N., Dessau, R. B., Krogfelt, K. A., Bodilsen, J., Andersen, N. S., Møller, J. K., Roed, C., Omland, L. H., Christiansen, C. B., Ellermann-Eriksen, S., Bangsborg, J. M., Hansen, K., Benfield, T. L., Rothman, K. J., Sørensen, H. T., Andersen, C. Ø. & Lebech, A-M. 30 maj 2018 I : BMJ. 361, s. k1998
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Bacterial biofilms: a possible mechanism for chronic infection in patients with lumbar disc herniation - a prospective proof-of-concept study using fluorescence in situ hybridization
Ohrt-Nissen, S., Fritz, B. G., Walbom, J., Kragh, K. N., Bjarnsholt, T., Dahl, B. & Manniche, C. maj 2018 I : APMIS - Journal of Pathology, Microbiology and Immunology. 126, 5, s. 440-447 8 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Natural and Vaccine-Induced Acquisition of Cross-Reactive IgG-Inhibiting ICAM-1-Specific Binding of a Plasmodium falciparum PfEMP1 Subtype Associated Specifically with Cerebral Malaria
Olsen, R. W., Ecklu-Mensah, G., Bengtsson, A., Ofori, M. F., Lusingu, J. P. A., Castberg, F. C., Hviid, L., Adams, Y. & Jensen, A. T. R. apr. 2018 I : Infection and immunity. 86, 4, s. pii: e00622-17
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Comparison of methods for measuring antibiotic consumption in an intensive care unit
Olsen, M. H., Anhøj, J., Knudsen, J. D., Frimodt-Møller, N. & Møller, K. 14 dec. 2018 I : APMIS - Journal of Pathology, Microbiology and Immunology. 127, 1, s. 33-40 8 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Complete Nucleotide Sequence of an Escherichia coli Sequence Type 410 Strain Carrying blaNDM-5 on an IncF Multidrug Resistance Plasmid and blaOXA-181 on an IncX3 Plasmid
Overballe-Petersen, S., Roer, L., Ng, K., Hansen, F., Justesen, U. S., Andersen, L. P., Stegger, M., Hammerum, A. M. & Hasman, H. 1 feb. 2018 I : Genome Announcements. 6, 5, s. e01542-17
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Invasive candidiasis
Pappas, P. G., Lionakis, M. S., Arendrup, M. C., Ostrosky-Zeichner, L. & Kullberg, B. J. 11 maj 2018 I : Nature reviews. Disease primers. 4, s. 18026
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review

Correction: Kinetics of antibody responses to PfRH5-complex antigens in Ghanaian children with Plasmodium falciparum malaria
Partey, F. D., Castberg, F. C., Sarbah, E. W., Silk, S. E., Awandare, G. A., Draper, S. J., Opoku, N., Kweku, M., Ofori, M. F., Hviid, L. & Barfod, L. 2018 I : PLoS One. 13, 9, s. e0204452
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Kinetics of antibody responses to PfRH5-complex antigens in Ghanaian children with Plasmodium falciparum malaria
Partey, F. D., Castberg, F. C., Sarbah, E. W., Silk, S. E., Awandare, G. A., Draper, S. J., Opoku, N., Kweku, M., Ofori, M. F., Hviid, L. & Barfod, L. 2018 I : PLoS One. 13, 6, s. e0198371
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Bacterial biofilm formation inside colonic crypts may accelerate colorectal carcinogenesis
Raskov, H., Kragh, K. N., Bjarnsholt, T., Alamili, M. & Gögenur, I. 17 sep. 2018 I : Clinical and Translational Medicine. 7, 1, s. 30
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

The importance of early diagnosis of Mycobacterium abscessus complex in patients with cystic fibrosis
Ravnholt, C., Kolpen, M., Skov, M., Moser, C., Katzenstein, T. L., Pressler, T., Høiby, N. & Qvist, T. dec. 2018 I : APMIS - Journal of Pathology, Microbiology and Immunology. 126, 12, s. 885-891 7 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review

Sequence Type 410 Is Causing New International High-Risk Clones
Roer, L. , Overballe-Petersen, S. , Hansen, F. , Schønning, K. , Wang, M. , Røder, B. L. , Hansen, D. S. , Justesen, U. S. , Andersen, L. P. , Fulgsang-Damgaard, D. , Hopkins, K. L. , Woodford, N. , Falgenhauer, L. , Chakraborty, T. , Samuelsen, Ø. , Sjöström, K. , Johannesen, T. B. , Ng, K. , Nielsen, J. , Ethelberg, S. & 3 flere Stegger, M., Hammerum, A. M. & Hasman, H. 1 jul. 2018 I : mSphere. 3, 4, e00337-18
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

High-resolution in situ transcriptomics of Pseudomonas aeruginosa unveils genotype independent patho-phenotypes in cystic fibrosis lungs
Rossi, E., Falcone, M., Molin, S. & Johansen, H. K. 27 aug. 2018 I : Nature Communications. 9, 1, s. 3459
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Biofilm and motility in response to environmental and host-related signals in Gram negative opportunistic pathogens
Rossi, E., Paroni, M. & Landini, P. 28 aug. 2018 I : Journal of Applied Microbiology. s. 1587-1602 16 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review

Dissemination and Characteristics of a Novel Plasmid-Encoded Carbapenem-Hydrolyzing Class D β-Lactamase, OXA-436 from Four Patients Involving Six Different Hospitals in Denmark
Samuelsen, Ø., Hansen, F., Aasnæs, B., Hasman, H., Lund, B. A., Leiros, H-K. S., Lilje, B., Janice, J., Jakobsen, L., Littauer, P., Søes, L. M., Holzknecht, B. J., Andersen, L. P., Stegger, M., Andersen, P. S. & Hammerum, A. M. 2018 I : Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 62, 1, s. e01260-17
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Morphological evidence of biofilm in chronic obstructive sialadenitis
Schrøder, S. A., Eickhardt, S., Bjarnsholt, T., Nørgaard, T. & Homøe, P. 2018 I : The Journal of laryngology and otology. 132, 7, s. 611-614 4 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

A systematic review of studies on the faecal microbiota in anorexia nervosa: future research may need to include microbiota from the small intestine
Schwensen, H. F., Kan, C., Treasure, J., Høiby, N. & Sjögren, M. 2018 I : Eating and Weight Disorders. 23, 4, s. 399-418
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review

Recurrent terbinafine resistant Trichophyton rubrum infection in a child with congenital ichthyosis
Schøsler, L., Andersen, L. K., Arendrup, M. C. & Sommerlund, M. mar. 2018 I : Pediatric Dermatology. 35, 2, s. 259-260 2 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Human genetic variation in GLS2 is associated with development of complicated Staphylococcus aureus bacteremia
Scott, W. K. , Medie, F. M. , Ruffin, F. , Sharma-Kuinkel, B. K. , Cyr, D. D. , Guo, S. , Dykxhoorn, D. M. , Skov, R. L. , Bruun, N. E. , Dahl, A. , Lerche, C. J. , Petersen, A. , Larsen, A. R. , Lauridsen, T. K. , Johansen, H. K. , Ullum, H. , Sørensen, E. , Hassager, C. , Bundgaard, H. , Schønheyder, H. C. & 9 flere Torp-Pedersen, C., Østergaard, L. B., Arpi, M., Rosenvinge, F., Erikstrup, L. T., Chehri, M., Søgaard, P., Andersen, P. S. & Fowler, V. G. 5 okt. 2018 I : P L o S Genetics. 14, 10, s. e1007667
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Traffic flow and microbial air contamination in operating rooms at a major teaching hospital in Ghana
Stauning, M. T., Bediako-Bowan, A., Andersen, L. P., Opintan, J. A., Labi, A. K., Kurtzhals, J. A. L. & Bjerrum, S. 1 jul. 2018 I : Journal of Hospital Infection. 99, 3, s. 263-270 8 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Tools for studying growth patterns and chemical dynamics of aggregated Pseudomonas aeruginosa exposed to different electron acceptors in an alginate bead model
Sønderholm, M., Koren, K., Wangpraseurt, D., Jensen, P. Ø., Kolpen, M., Kragh, K. N., Bjarnsholt, T. & Kühl, M. 2018 I : NPJ biofilms and microbiomes. 4, s. 3-13 11 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Antiviral resistance due to deletion in the neuraminidase gene and defective interfering-like viral polymerase basic 2 RNA of influenza A virus subtype H3N2
Trebbien, R., Christiansen, C. B. & Fischer, T. K. maj 2018 I : Journal of clinical virology : the official publication of the Pan American Society for Clinical Virology. 102, s. 1-6 6 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Catheter-Related Bloodstream Infections in Adults Receiving Home Parenteral Nutrition
Tribler, S., Brandt, C. F., Hvistendahl, M., Staun, M., Brøbech, P., Moser, C. E. & Jeppesen, P. B. 2018 I : Journal of Parenteral and Enteral Nutrition. 42, 2, s. 393-402
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Catheter-Related Bloodstream Infections in Adults Receiving Home Parenteral Nutrition: Substantial Differences in Incidence Comparing a Strict Microbiological to a Clinically Based Diagnosis
Tribler, S., Brandt, C. F., Hvistendahl, M., Staun, M., Brøbech, P., Moser, C. E. & Jeppesen, P. B. feb. 2018 I : Journal of Parenteral and Enteral Nutrition. 42, 2, s. 393-402 10 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Catheter-related bloodstream infections in patients with intestinal failure receiving home parenteral support: risks related to a catheter-salvage strategy
Tribler, S., Brandt, C. F., Fuglsang, K. A., Staun, M., Broebech, P., Moser, C. E., Scheike, T. & Jeppesen, P. B. 1 maj 2018 I : The American journal of clinical nutrition. 107, 5, s. 743-753 11 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Uncontrolled gelatin degradation in non-healing chronic wounds
Trøstrup, H., Holstein, P., Karlsmark, T., Moser, C. & Ågren, M. S. 2 nov. 2018 I : Journal of wound care. 27, 11, s. 724-734 11 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Pseudomonas aeruginosa biofilm hampers murine central wound healing by suppression of vascular epithelial growth factor
Trøstrup, H., Lerche, C. J., Christophersen, L. J., Thomsen, K., Jensen, P. Ø., Hougen, H. P., Høiby, N. & Moser, C. feb. 2018 I : International Wound Journal. 15, 1, s. 123-132 10 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Methodologies for in vitro and in vivo evaluation of efficacy of antifungal and antibiofilm agents and surface coatings against fungal biofilms
Van Dijck, P. , Sjollema, J. , Cammue, B. P. , Lagrou, K. , Berman, J. , d'Enfert, C. , Andes, D. R. , Arendrup, M. C. , Brakhage, A. A. , Calderone, R. , Cantón, E. , Coenye, T. , Cos, P. , Cowen, L. E. , Edgerton, M. , Espinel-Ingroff, A. , Filler, S. G. , Ghannoum, M. , Gow, N. A. R. , Haas, H. & 19 flere Jabra-Rizk, M. A., Johnson, E. M., Lockhart, S. R., Lopez-Ribot, J. L., Maertens, J., Munro, C. A., Nett, J. E., Nobile, C. J., Pfaller, M. A., Ramage, G., Sanglard, D., Sanguinetti, M., Spriet, I., Verweij, P. E., Warris, A., Wauters, J., Yeaman, M. R., Zaat, S. A. J. & Thevissen, K. 14 jun. 2018 I : Microbial Cell Factories. 5, 7, s. 300-326 27 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Review › Forskning › peer review

Interleukin-26 (IL-26) is a novel anti-microbial peptide produced by T cells in response to staphylococcal enterotoxin
Woetmann, A., Alhede, M., Dabelsteen, S., Bjarnsholt, T., Rybtke, M., Nastasi, C., Krejsgaard, T., Andersen, M. H., Bonefeld, C. M., Geisler, C., Givskov, M. & Odum, N. 13 apr. 2018 I : Oncotarget. 9, 28, s. 19481-19489 9 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Azole-Resistance in Aspergillus terreus and Related Species: An Emerging Problem or a Rare Phenomenon?
Zoran, T. , Sartori, B. , Sappl, L. , Aigner, M. , Sánchez-Reus, F. , Rezusta, A. , Chowdhary, A. , Taj-Aldeen, S. J. , Arendrup, M. C. , Oliveri, S. , Kontoyiannis, D. P. , Alastruey-Izquierdo, A. , Lagrou, K. , Cascio, G. L. , Meis, J. F. , Buzina, W. , Farina, C. , Drogari-Apiranthitou, M. , Grancini, A. , Tortorano, A. M. & 30 flere Willinger, B., Hamprecht, A., Johnson, E., Klingspor, L., Arsic-Arsenijevic, V., Cornely, O. A., Meletiadis, J., Prammer, W., Tullio, V., Vehreschild, J-J., Trovato, L., Lewis, R. E., Segal, E., Rath, P-M., Hamal, P., Rodriguez-Iglesias, M., Roilides, E., Arikan-Akdagli, S., Chakrabarti, A., Colombo, A. L., Fernández, M. S., Martin-Gomez, M. T., Badali, H., Petrikkos, G., Klimko, N., Heimann, S. M., Uzun, O., Roudbary, M., de la Fuente, S. & Houbraken, J. 2018 I : Frontiers in Microbiology. 9, s. 516
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

Pharmacokinetics and Pharmacodynamics of Fosfomycin and Its Activity against Extended-Spectrum-β-Lactamase-, Plasmid-Mediated AmpC-, and Carbapenemase-Producing Escherichia coli in a Murine Urinary Tract Infection Model
Zykov, I. N., Samuelsen, Ø., Jakobsen, L., Småbrekke, L., Andersson, D. I., Sundsfjord, A. & Frimodt-Møller, N. jun. 2018 I : Antimicrobial Agents and Chemotherapy. 62, 6, s. e02560-17
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review

The accessibility of topical treatment in the paranasal sinuses on operated cystic fibrosis patients assessed by scintigraphy
Aanaes, K., Alanin, M. C., Nielsen, K. G., Moller Jorgensen, M., von Buchwald, C., Hoiby, N., Johansen, H. K., Johannesen, H. H. & Mortensen, J. 1 sep. 2018 I : Rhinology. 56, 3, s. 268-273 6 s.
Publikation: Bidrag til tidsskrift › Tidsskriftartikel › Forskning › peer review