Stamafdelingens personale afgør sammen med patienten om indlæggelse på Patienthotellet er en mulighed. Da patienten er indlagt er ophold på hotellet uden omkostninger for patienten.
Under opholdet vil stamafdelingen fortsat have ansvart for behandlingen.
Pårørende til Rigshospitalets patienter har også mulighed for at indlogere sig på Patienthotellet.
Patienthotellet disponerer indtil 31. juli 2013 over 32 gæsteværelser, som er beliggende i udkanten af hospitalsområdet, kun få minutters gang fra Patienthotellet og alle Rigshospitalets afdelinger.
Her har hver gæst eget værelse, men deler bad, toilet samt køkken med en anden gæst. Værelserne er billigere end på Patienthotellet. Der er mulighed for selv at lave mad, og køkkenet er udstyret med diverse faciliteter. Gæster kan også vælge at købe mad i Patienthotellets restaurant.