Patologiafdelingen, som er en del af Diagnostisk Center, betjener Rigshospitalet, Frederiksberg Hospitals gynækologiske afdeling samt Grønland og Færøerne sundhedsvæsen med patologisk-anatomisk diagnostik baseret på mikroskopiundersøgelser af organer, væv og celler. Patologiafdelingens videnskabelige satsningsområder er fosterpatologi, onkologi, transplantations- og neuropatologi. Afdelingen underviser medicinske studenter, laborantstuderende og lægesekretær-elever samt deltager i speciallægeuddannelsen i patologisk anatomi og cytologi.
Med ca. 90 medarbejdere er patologiafdelingen internt struktureret i seks teams med egne specialfunktioner og diagnostiske ekspertområder:
Finsen Team:Hæmotologi, hoved-, hals- og hudpatologi.
Juliane-marie Team: Foster-, børne- og gynækologisk patologi.
Mamma-orto-thyreoidea Team: Mamma-, parathyreoidea- og thyreoideapatologi samt bløddels- og knoglepatologi.
Neuro Team: Hjerne-, nerve- og muskelpatologi. Teamet er center for patoanatomisk diagnostik af prionsygdomme.
TX Team:Hjerte-, nyre- og lungepatologi samt lever- og gastropatologi. Herunder transplantationspatologi.
Bartholin Instituttet:Eksperimentel patologi med hovedvægt på cancer, immunologi og diabetes.